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北京工商大学研究生教育始于1979年，是1981年被国务院批准为全国首批具有硕士学位授权的单位之一。2003年8月，经国务院学位委员会第20次会议审核批准，学校成为联合培养博士研究生单位，2004年起与中央财经大学联合招收和培养会计学专业博士研究生。2012年12月，学校食品（含保健食品）添加剂与安全成为“服务国家特殊需求博士人才培养项目”，授予学位学科名称为“食品科学与工程”。2014年9月，学校食品科学与工程一级学科博士后流动站授牌设立，为我校的人才储备、人才引进、人才培养和学科建设带来了新的机遇、注入了新的活力。2018年5月，我校获批博士学位授予单位，应用经济学、食品科学与工程获批一级学科博士学位授权点。2021年11月，我校系统科学、轻工技术与工程、工商管理3个学科成功获批一级学科博士学位授权点。截至2021年12月31日，学校有在读博士生199人（含留学生74人）、硕士生3405人（含留学生102人）。

学校以创建特色鲜明的高水平研究型大学为目标，坚持以学科建设为龙头，以优势学科为主干，大力推进一流学科建设，促进学科交叉融合，形成了一批优势特色学科。2002年-2012年，我校获批应用化学、产业经济学、食品科学和会计学4个北京市重点学科，应用经济学、民商法学、材料加工工程、计算机应用技术、环境工程和企业管理6个北京市重点建设学科。2019年我校应用经济学、食品科学与工程和工商管理3个学科入选北京高校高精尖学科建设名单，其中食品科学与工程和工商管理学科为与央属高校共建学科。2021年，食品科学与工程学科位列“2021软科世界一流学科排名”世界第20位，农业科学学科进入esi排名世界前2.38‰，化学学科进入esi排名世界前1%。学校现有应用经济学和食品科学与工程2个博士后科研流动站，应用经济学、系统科学、轻工技术与工程、食品科学与工程和工商管理5个一级学科博士学位授权点，拥有理论经济学、应用经济学、法学、马克思主义理论、新闻传播学、化学、系统科学、统计学、机械工程、材料科学与工程、控制科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、轻工技术与工程、环境科学与工程、食品科学与工程、管理科学与工程和工商管理等18个一级学科硕士学位授权点，拥有金融、应用统计、税务、国际商务、保险、资产评估、法律、翻译、新闻与传播、电子信息、机械、材料与化工、资源与环境、生物与医药、工商管理、会计、旅游管理、工程管理和艺术等19个专业硕士学位授权点。学校建立了严格的导师的遴选制度和规范的导师培训制度，不断完善导师教书育人和科研水平评价体系，形成了一支职称、学历、年龄结构合理，包括院士、国家“万人计划”科技创新领军人才、国家优秀青年科学基金获得者、国家级百千万人才、全国优秀教师等在内的高水平的导师队伍。高水平的导师队伍是我校研究生教育的有力支撑和保障。

学校围绕“立德树人”根本任务，构建三全育人研究生工作体系，努力探索研究生分层次、分类别培养模式，不断深化研究生教育改革，努力提升研究生培养质量。一是通过两季两节两校一平台（迎新季、毕业季、学术节、文化节、党校、干校、校研会微信平台）、课程思政和思政课程建设和“明德大讲堂”等工作体系，将德育教育贯穿研究生学术能力培养和专业能力培养的始终，将思政教育融入专业教育的研究生课程体系，致力于培养堪当民族复兴大任的时代新人。二是通过示范学位点建设、示范课程建设、精品课程建设，以及加大学科竞赛和研究生联合培养基地建设的支持力度等方式，不断提升研究生的培养质量；三是注重培养研究生独立研究能力和创新能力，每年资助100项研究生主持创新能力提升科研项目，组织“研究生学术环游300秒”、“研究生学术之星”评选,组织学科竞赛和系列高端讲座等学术活动，培养研究生学术兴趣，提高研究生科技创新能力。四是高度重视研究生论文质量，自2009年开始实施学位论文答辩“末位监控”制度，受到教育部的高度肯定，同时不断加强学位论文过程管理和论文质量的后期评估，将学位论文开题报告末位和中期检查末位的学生纳入监控范围，并建立了完善的学位论文市、校、院三级抽检制度。五是研究生教育规范化程度进一步提高，研究生院先后推出《导师手册》、《研究生手册》、《研究生培养方案》和《研究生教育质量报告》等文件，标志着我校研究生培养在实现规范化、精细化管理道路上再上新的台阶。基于学校研究生培养水平的不断提升，我校毕业生就业形势乐观，就业率达到99%左右，研究生入职薪酬位列市属高校前列。